4、区域发展不平衡性，鲜品储存周期短，销售费用过高，销售渠道有限。5、羊肚菌周年化生产技术还没有突破，当前产量很不稳定，稍有不慎，不出菇或颗粒无收的事情时有发生，造成种植者血本无归。6、行业虚假宣传，假培训层出不穷，种植者学习和掌握真本领很难，稍有不慎，高额的学费就打了水漂。7、行业管理不规范，羊肚菌品牌化之路刚开始，深加工产品虽有问世，但只是起步阶段，有很长的路要走。8、羊肚菌自从可以人工栽培后，在高额利润的刺激下，很多人转产到这个行业，产量连年创新高，价格不断下跌。种植者收益连年下降。

台湾野生羊肚菌羊肚菌的分离鉴定方法：大多数分离物的菌丝体、菌落形态差异不大，大多数的分离物在适当培养基上都会产生菌核，大多数分离物大田栽培后都会产生分生孢子，不是每一个分离物都会出菇，能够出菇的菌株不一定会高产。优质野生羊肚菌野生羊肚菌及其驯化研究存在的问题及展望，他指出，野生标本分离得到的菌株的菌丝形态、菌核形成、无性型分生孢子等与栽培菌株相同，无法区别；腐生的黑色种类容易出菇，共生的黄色种类不容易出菇；除梯棱羊肚菌、六妹羊肚菌以外，其他菌种的产量都很低，1-10个/m²；对于羊肚菌必须大量进行筛选、出菇试验以后才能够用于实际生产。

市面上出售的羊肚菌有新鲜和干货之分。新鲜的通常被超市冷冻于冻库保鲜。干的羊肚菌则是经过晾晒后得到的干品，味道也更加醇厚。干的羊肚菌需要经过泡发后才能食用。泡发羊肚菌水的量要适度，以刚刚浸过菇面为宜，大约二三十分钟后水变成酒红色，羊肚菌完全变软即可捞出洗净备用，发菌的酒红色原汤经沉淀泥 砂后要用于烧菜，炖汤。切记这酒红色的原汤是羊肚菌味道和养分的精华所在。

羊肚菌中其他的成份主要包括色素类、醇和皂类，还含有4种叶黄素和3种胡萝卜素。羊肚菌的药理作用显著，具有抗肿瘤、调节机体免疫力和抗疲劳、保肝保肾之功效，抗血栓抗辐射、调节胃肠蠕动、降血脂等功能。（参考文献：雷艳等.羊肚菌化学成分及药理作用研究进展[A].青海师范大学学报，2013，1001-7542 02-0059-05）羊肚菌的营养价值和功效也是羊肚菌风靡的原因之一，使其“贵的有理”。

六妹羊肚菌(Morchella sextelata M.Kuo)，商品名为羊肚菌或火烧羊肚菌。隶属于子囊菌门(Ascomycota)、盘菌纲(Discomycetes)、盘菌目(Pezizales)、羊肚菌科(Morchellaceae)，羊肚菌属(Morchella)。为我国近年驯化栽培成功的羊肚菌属物种之一。野生种主要分布在我国云南、四川、西藏、甘肃及美国洛杉矶等地的火烧过的土壤上。2013年至今，我国西部地区的广大羊肚菌爱好者开始对六妹羊肚菌进行了大量人工种植尝试和产业化开发。然而，由于受气候条件和田间栽培管理技术的影响，其产量一直不稳定低、商品价值层次不齐。因此，提出一种获得高产量和高品质的六妹羊肚菌栽培田间管理方法，是目前六妹羊肚菌产业化开发过程中亟待研究解决的问题之一。